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在阿里巴巴的股权中，占据最多股份的是日本软银，其拥有阿里巴巴34.7%的股份，股权第二多的是美国的雅虎，拥有阿里巴巴22.8%的股份，反而阿里巴巴创始人马云只排在第三，拥有7%的股份。但是，虽然马云拥有的股份比日本软件银行和美国雅虎少，但他是阿里巴巴中最有话语权的，控制着整个阿里巴巴的发展走向，软银和雅虎虽有控股但无任何话语权。
马云一直以来就对公司的控制权十分重视，在阿里巴巴最初创立的时候，马云就规定了：软银和雅虎所占有的股份虽然高，但只能拿分红，不能参与阿里巴巴的决策。如今，马云与阿里高管在阿里巴巴中有一半以上的投票权，而造就马云他们拥有这么多大的话语权，原因就是阿里巴巴所实行的双重股份制度。
这种股份制度是在阿里巴巴内部执行两种股份权利，让管理层的人可以在控股比例较少的情况下掌控公司。一般情况下，股东持有的股份只有1票的投票权或根本没有投票权，而拥有2到10票的投票权的股份由公司的管理层持有。所以说，日本软银和美国雅虎虽然持股多，但他们没有任何话语权。
阿里巴巴一直以来就是以马云提倡的这种模式来招合伙人，这使得阿里巴巴从创立至今，虽然获得了多次的投资，但是马云却手握公司最大控制权的重要原因。